囊胚阶段形成特定的细胞排列与腔隙，早期卵裂不一定伴随胚胎总体积同步增大_胚胎发育与繁殖

组织张力与机械作用参与胚胎形状变化。器官发生依靠多类细胞协调构建结构。神经管形成是许多脊椎动物发育的重要步骤。脊索能够为周围组织提供诱导信号。体节参与形成脊椎动物部分轴向组织。肢芽发育整合多个方向的位置信息。左右不对称发育使内部器官形成特定排列。胎盘在部分哺乳动物中连接母体与胚胎。

形态发生涉及细胞增殖迁移和形状改变。形态素浓度梯度可以提供空间位置信息。细胞对梯度的响应还受到时间与背景影响。同源异形基因参与身体区域身份的建立。发育调控基因在不同动物间常具有保守性。基因表达边界帮助形成组织与器官分区。程序性细胞死亡可雕塑发育中的器官形态。细胞黏附差异影响细胞群体的排列方式。

卵裂通过连续分裂增加早期胚胎细胞数量。早期卵裂不一定伴随胚胎总体积同步增大。囊胚阶段形成特定的细胞排列与腔隙。原肠运动建立胚胎主要胚层和身体格局。外胚层参与形成表皮与神经系统等结构。中胚层形成肌肉骨骼和多种内部组织。内胚层参与形成消化管内衬等结构。胚胎诱导通过组织间信号影响细胞命运。