顺反异构可出现于受限旋转的结构之中（平面中间体的形成可能影响产物立体分布）

平面中间体的形成可能影响产物立体分布。烯烃加成的空间结果取决于具体反应机理。糖分子的多个立体中心产生丰富异构关系。氨基酸的立体构型影响蛋白质的空间结构。天然蛋白质主要由特定构型氨基酸组成。核酸糖环的立体结构影响遗传物质构象。楔线结构式用于表达纸面外的化学键方向。纽曼投影从指定碳碳键方向观察分子构象。

环己烷椅式构象能够减小部分空间张力。轴向与赤道向取代基处于不同空间环境。体积较大基团通常偏好空间排斥较小的位置。立体位阻会影响反应物接近活性中心的能力。同一化学式的不同立体结构可能有不同气味。生物酶常能区分底物的不同对映体。手性环境使对映体可能表现不同相互作用。对映体在非手性环境中的许多物理性质相同。

哈沃斯投影常用于表示环状糖的结构。投影式的旋转操作可能改变或保持原构型。构型变化通常需要断键或经历特定反应过程。分子模型可以帮助辨认空间重合与镜像关系。手性轴也能使分子呈现稳定的对映结构。阻转异构来自受限旋转形成的可分离构型。立体结构描述必须明确所采用的表示约定。空间结构信息是理解生物分子识别的重要基础。