反应溶剂会显著影响离子和过渡态稳定性，取代反应以一个原子或基团替换原有部分，重排反应会改变分子内部的连接顺序

伯醇氧化在不同条件下可形成醛或羧酸。仲醇氧化通常形成相应酮类化合物。叔醇的常规温和氧化行为不同于伯醇。醛容易在某些温和氧化条件下转为羧酸。酮的普通氧化通常需要更苛刻的条件。羰基碳可作为多种亲核加成的反应中心。酯化反应能够在羧酸与醇之间发生。酯水解在酸性与碱性条件下具有不同特点。

蒸馏依靠不同组分挥发性的差异进行分离。分馏适合分离沸点较接近的可挥发组分。减压蒸馏能够降低某些物质的沸腾温度。色谱可用于分离结构与性质相近的有机物。反应监测有助于判断底物消耗和副产物生成。有机反应机理中的箭头表示电子移动方向。弯箭头并不表示原子沿弧线路径实际飞行。有机合成条件需要兼顾效率选择性与物料利用。

反应溶剂会显著影响离子和过渡态稳定性。极性非质子溶剂可能增强某些亲核取代过程。离去基团能力影响取代与消除反应的难易。碳正离子的稳定性受到取代与共振效应影响。碳负离子的稳定性与吸电子基团等因素有关。自由基可以通过化学键的均裂过程产生。化学键异裂使成键电子对归属于其中一方。化学键均裂通常让两端各获得一个电子。