形态发生涉及细胞增殖迁移和形状改变，克隆个体并不保证所有表型完全相同，形态素浓度梯度可以提供空间位置信息

克隆个体并不保证所有表型完全相同。生殖细胞谱系负责连接不同世代的遗传传递。发育中的表观遗传重编程重塑部分调控状态。器官大小受到细胞数量和单个细胞大小影响。形态稳定性依靠发育过程中的误差缓冲机制。演化发育生物学比较不同物种的发育机制。相似发育基因可以在不同结构形成中被重复利用。胚胎发育并非简单重演成年祖先的全部形态。动物行为包括运动交流学习与资源选择。

卵裂通过连续分裂增加早期胚胎细胞数量。早期卵裂不一定伴随胚胎总体积同步增大。囊胚阶段形成特定的细胞排列与腔隙。原肠运动建立胚胎主要胚层和身体格局。外胚层参与形成表皮与神经系统等结构。中胚层形成肌肉骨骼和多种内部组织。内胚层参与形成消化管内衬等结构。胚胎诱导通过组织间信号影响细胞命运。

胎盘交换不意味着母体与胎儿血液完全混合。卵黄为许多动物的早期发育提供营养。卵生胎生与卵胎生代表不同生殖发育方式。变态过程涉及幼体组织重塑与成体结构形成。两栖动物变态受到激素与环境共同影响。昆虫蛹期包含活跃而复杂的组织重建。直接发育不经历明显的自由生活幼体阶段。间接发育包含与成体差异显著的幼体阶段。

幼态延续可使成体保留某些祖先幼体特征。发育异时性指发育事件时间或速率的演化改变。发育可塑性使相同基因型产生不同环境响应。关键期内的环境因素可能留下长期影响。母源物质能够影响胚胎最早期的发育过程。胚胎自身基因组在特定阶段开始广泛表达。双胞胎可以来自一个或两个受精卵来源。同卵双胞胎也可能因环境形成部分差异。